Η λίμνη πλαστήρα με το πέρασμα των χρόνων, ανέπτυξε το δικό της οικοσύστημα. Στα νερά της υπάρχει έντονη θαλάσσια ζωή, αφού είναι πολλά τα είδη ψαριών. Μερικά από τα είδη ψαριών που θα συναντήσουμε στη λίμνη Πλαστήρα είναι: κορεγόνοι, κυπρίνοι, χέλια, πέστροφα ,λαυράκια, γριβάδια , ασπρόψαρο, και πεταλούδα. Επίσης, στην περιοχή συναντώνται πολλά είδη πουλιών της πανίδας των Αγράφων, όπως μαυρόκοτες, ερωδιούς , διάφορα είδη γλάρων, ενώ σπανιότερα είναι οι κορμοράνοι και τα βουτηχτάρια.

Όσον αφορά την πανίδα στη Λίμνη Πλαστήρα υπάρχουν αμέτρητα έλατα, βελανιδιές και καστανιές τα οποία κατεβαίνουν ως τις όχθες. Επίσης υπάρχουν λεύκες και πλατάνια κυρίως κοντά στους ποταμούς και εποχιακή χαμηλή βλάστηση. Όσο όμως υψηλότερα ανεβαίνουμε από το επίπεδο της θάλασσας το τοπίο αλλάζει. Πιο ψηλά υπάρχουν πλατύφυλλες βελανιδιές και έλατα. Τέλος , μοναδικό αποτελεί το γεγονός πως οι βουνοκορφές προς τα δυτικά σχηματίζουν το προφίλ μιας γυναίκας που κοιμάται, την περίφημη "Κοιμωμένη των Αγράφων" η οποία διακρίνεται από ένα πολύ μεγάλο μέρος του Θεσσαλικού κάμπου.